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CONTRATO DE SERVICIOS DE SECUENCIACIÓN DE EPIGENOMA DE CÉLULA ÚNICA (SCATAC- SEQ) EN LINFOCITOS B CIRCULANTES MEDIANTE PLATAFORMA BD RHAPSODY O EQUIVALENTE PARA EL PROYECTO PI24/00382. EXPEDIENTE IDIVAL 10/2026. INFORME DE NECESIDADES. 1.- Antecedentes. La Dra. Raquel López Mejías resultó beneficiaria de una subvención del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) dentro del programa Proyectos de Investigación en Salud (FIS) de la Acción Estratégica en Salud 2021-2023, de la convocatoria 2024, para la ejecución del Proyecto PI24/00382 “Perfil epigenómico de la vasculitis IgA: primer estudio de accesibilidad de la cromatina en todo el genoma a nivel de célula única de linfocitos B circulantes”, según resulta de la Resolución del Director del Instituto de Salud Carlos III de 27 de diciembre de 2024 que se adjunta en Anexo I. El objetivo del Proyecto de Investigación PI24/00382 “Perfil epigenómico de la vasculitis IgA: primer estudio de accesibilidad de la cromatina en todo el genoma a nivel de célula única de linfocitos B circulantes” es dilucidar los mecanismos moleculares implicados en la patogénesis de la IgAV, a través de una amplia caracterización del paisaje epigenómico de esta vasculitis, mediante la realización del primer estudio de accesibilidad de la cromatina en todo el genoma a nivel de célula única (scATAC-seq) de linfocitos B periféricos. Para la consecución del objetivo principal, el proyecto cuenta con los siguientes objetivos específicos: Identificar diferentes subpoblaciones de células B periféricas asociadas con la patogénesis de la IgAV (específicas de la susceptibilidad a IgAV, la gravedad de IgAV y relacionadas con el sexo y la edad al inicio de la enfermedad) en función de su perfil epigenómico; identificar regiones relevantes accesibles a la cromatina, perfiles de accesibilidad de unión al factor de transcripción (TF) y huellas de TF en las diferentes subpoblaciones de células B periféricas identificadas como asociadas con la patogénesis de IgAV; identificar vías biológicas implicadas en la patogénesis de la IgAV y objetivos potenciales para fármacos específicos de la IgAV; validar los resultados epigenómicos obtenidos utilizando datos de transcriptoma a nivel de célula única de células B periféricas de pacientes con IgAV. Teniendo en cuenta lo expuesto anteriormente, en el marco de este Proyecto y tal como consta en su Memoria presentada ante el Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) y aprobada por resolución de ese organismo, está previsto realizar el primer estudio scATAC-seq de linfocitos B periféricos de pacientes con IgAV e individuos sanos. Esta es una técnica de vanguardia en biología molecular y genómica funcional que permite analizar cómo está organizada y accesible la cromatina en cada célula individual de una muestra, permitiendo, así, identificar las regiones del genoma que están accesibles a la maquinaria transcripcional dentro de células individuales. En particular, este primer estudio scATAC- seq se llevará a cabo mediante la plataforma BD Rhapsody o equivalente, una herramienta novedosa y compleja que permite realizar un perfilado de accesibilidad de cromatina a nivel de célula individual. El sistema aísla núcleos individuales y etiqueta los fragmentos de ADN accesible mediante códigos de barras únicos introducidos durante la tagmentación, lo que posibilita la identificación inequívoca de cada célula. Esta tecnología permite procesar y analizar miles de núcleos en paralelo siguiendo un flujo

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