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CONTRATO DE SERVICIOS DE SECUENCIACIÓN DE EPIGENOMA DE CÉLULA ÚNICA (SCATAC-SEQ) EN LINFOCITOS B CIRCULANTES MEDIANTE PLATAFORMA BD RHAPSODY O EQUIVALENTE PARA EL PROYECTO PI24/00382. EXPEDIENTE IDIVAL 10/2026. PLIEGO DE PRESCRIPCIONES TÉCNICAS PARTICULARES 1.- OBJETO DEL CONTRATO El objeto del contrato consiste en la prestación, por el adjudicatario, de los servicios que precise IDIVAL de secuenciación del epigenoma mediante el primer estudio de accesibilidad de la cromatina en todo el genoma a nivel de célula única (scATAC-seq) de linfocitos B de sangre periférica mediante la plataforma BD Rhapsody o equivalente de una cohorte de 12 pacientes diagnosticados de vasculitis mediada por IgA (IgAV) y de una cohorte de 12 individuos sanos para el Proyecto PI24/00382. La prestación comprenderá el aislamiento y control de calidad de los núcleos, la tagmentación de la cromatina accesible, la captura y etiquetado individual de los núcleos, la preparación y control de calidad de las librerías y su secuenciación masiva. IDIVAL precisa, para la ejecución del trabajo de secuenciación del epigenoma de célula única descrito anteriormente, contratar un equipo especializado que se encargue de la realización de las citadas secuenciaciones, corriendo a cargo del adjudicatario todos los reactivos, consumibles, equipamiento y recursos humanos y técnicos necesarios para la correcta ejecución del servicio. 2.- CARACTERÍSTICAS DEL SERVICIO. El objetivo del Proyecto de Investigación PI24/00382 “Perfil epigenómico de la vasculitis IgA: primer estudio de accesibilidad de la cromatina en todo el genoma a nivel de célula única de linfocitos B circulantes” es dilucidar los mecanismos moleculares implicados en la patogénesis de la IgAV, a través de una amplia caracterización del paisaje epigenómico de esta vasculitis, mediante la realización del primer estudio de scATAC-seq de linfocitos B periféricos. Los resultados derivados de esta técnica permitirán identificar subtipos de células B periféricas con perfiles epigenómicos diferentes que están asociadas con la patogénesis de la IgAV, así como regiones relevantes accesibles a la cromatina, perfiles de accesibilidad de unión al factor de transcripción (TF) y huellas de TF en las diferentes subpoblaciones de dichas células B e identificar vías biológicas implicadas en la patogénesis de la enfermedad. Para el desarrollo del Proyecto PI24/00382 se han recogido muestras sanguíneas de una cohorte de pacientes con IgAV e individuos sanos, a partir de las cuales se han aislado y purificado las células B que se someterán al scATAC-seq mediante la plataforma BD Rhapsody o equivalente. Esta tecnología de vanguardia en genómica funcional permite estudiar, en cada célula individual, la organización y accesibilidad de la cromatina, identificando las regiones del genoma potencialmente activas y disponibles para la maquinaria transcripcional. Durante el proceso se etiquetan los fragmentos de ADN accesible generados por la transposasa Tn5, preservando la identidad celular de cada núcleo. El análisis scATAC-seq en la plataforma BD Rhapsody o equivalente proporciona una resolución unicelular del paisaje epigenético y ha mostrado su utilidad en la caracterización de mecanismos reguladores en enfermedades inflamatorias y autoinmunes con rasgos patogénicos semejantes a la IgAV.

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